小功率激光照射具有明顯的生物刺激作用和調節作用，目前認為小功率的氦氖激光照射的治療作用不是靠溫熱效應，而是光的生物化學反應，因此又被稱為冷激光。在光生物化學反應的基礎上，可影響細胞膜的通透性，影響組織中一些的活性，如激化過氧化氫酶，進而可調節或增強代謝，可加強組織細胞中核糖核酸的合成和活性，加強蛋白質的合成；可使被照射的部位中糖原含量繒加；可使肝細胞線粒體合成三磷酸腺甘（ATP）的功能增強，用於照射頭皮毛囊時可加束毛發生長，並加強頭發本身的緊固度、密度以及頭發的彈性，令頭發烏黑亮澤。
小功率激光照射具有消炎、鎮痛、脫敏、止癢、收斂、消腫、促進肉芽生長、加速傷口、潰瘍、燒傷的愈合等作用，可使成纖維細胞的數目增加，因而增加膠原的形成，可加快血管的新生和新生細胞的繁殖過程，基於其對代謝和組織修復過程的良好影響，可促進傷口愈合，加快再植皮瓣生長，促進斷離神經再生，加速管狀骨骨折愈合，促進毛發生長，小功率激光的這一作用可用於治療精神性脫髮、產後脫髮、斑禿等。
小功率激光照射雖然不能直接殺滅細菌，但可加強機體的細胞和免疫機能，如加強白細胞的吞噬功能，可使吞噬細胞增加或增強巨噬細胞的活性，可使γ－球蛋白及補體滴度增加；此外，微生物檢查發現：激光照射可改變傷口部葡萄球菌對抗菌素的敏感性，由此可見，小功率激光對於治療脂溢性脫髮，特別是由真菌和嗜脂性真菌引起的脂溢性脫髮有獨特的療效。
另外可影響內分泌腺的功能，如加強甲狀腺、腎上腺等的功能，因而可調節整個體內的代謝過程；此外，並可引起周圍血液和凝血系列的改變，其基本規律是具有調節作用。小功率激光的這一重要作用可以應用於治療男型脫髮。
